MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 62970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021081	GCT	2	6	221805	221810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881871
4502	NC_021081	GGC	2	6	221811	221816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881871
4503	NC_021081	TGG	2	6	221822	221827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881871
4504	NC_021081	GGCGT	2	10	221842	221851	0 %	20 %	60 %	20 %	482881871
4505	NC_021081	TTC	2	6	221866	221871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881871
4506	NC_021081	ACC	2	6	221875	221880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881871
4507	NC_021081	ACCG	2	8	221886	221893	25 %	0 %	25 %	50 %	482881871
4508	NC_021081	GGC	2	6	221898	221903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881871
4509	NC_021081	CGG	2	6	221934	221939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881871
4510	NC_021081	GCTG	2	8	221951	221958	0 %	25 %	50 %	25 %	482881871
4511	NC_021081	CAG	2	6	222082	222087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881871
4512	NC_021081	GCC	2	6	222109	222114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881871
4513	NC_021081	TGG	2	6	222188	222193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881871
4514	NC_021081	CTG	2	6	222196	222201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881871
4515	NC_021081	CTG	2	6	222241	222246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881871
4516	NC_021081	CGG	2	6	222252	222257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881871
4517	NC_021081	CAC	2	6	222270	222275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881871
4518	NC_021081	CTT	2	6	222306	222311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881871
4519	NC_021081	GCG	3	9	222331	222339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881871
4520	NC_021081	GTT	2	6	222448	222453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881872
4521	NC_021081	TGC	2	6	222489	222494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881872
4522	NC_021081	GCT	2	6	222553	222558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881872
4523	NC_021081	C	7	7	222560	222566	0 %	0 %	0 %	100 %	482881872
4524	NC_021081	TGC	2	6	222666	222671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881872
4525	NC_021081	TGG	2	6	222744	222749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881872
4526	NC_021081	CGA	2	6	222766	222771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881872
4527	NC_021081	CTG	2	6	222794	222799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881872
4528	NC_021081	CGC	2	6	222858	222863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881872
4529	NC_021081	CG	3	6	222922	222927	0 %	0 %	50 %	50 %	482881872
4530	NC_021081	GGCC	2	8	222937	222944	0 %	0 %	50 %	50 %	482881872
4531	NC_021081	GCC	2	6	222980	222985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881872
4532	NC_021081	TGG	2	6	223050	223055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881872
4533	NC_021081	GTG	2	6	223133	223138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881872
4534	NC_021081	GCG	2	6	223139	223144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881872
4535	NC_021081	GGTGCT	2	12	223150	223161	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	482881872
4536	NC_021081	GGGC	2	8	223222	223229	0 %	0 %	75 %	25 %	482881872
4537	NC_021081	GTTG	2	8	223266	223273	0 %	50 %	50 %	0 %	482881873
4538	NC_021081	GGCA	2	8	223279	223286	25 %	0 %	50 %	25 %	482881873
4539	NC_021081	G	7	7	223294	223300	0 %	0 %	100 %	0 %	482881873
4540	NC_021081	CAG	2	6	223313	223318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881873
4541	NC_021081	ACG	3	9	223443	223451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881873
4542	NC_021081	GCGG	2	8	223465	223472	0 %	0 %	75 %	25 %	482881873
4543	NC_021081	G	6	6	223484	223489	0 %	0 %	100 %	0 %	482881873
4544	NC_021081	GGCC	2	8	223493	223500	0 %	0 %	50 %	50 %	482881873
4545	NC_021081	CAA	2	6	223585	223590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881873
4546	NC_021081	ACT	2	6	223626	223631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881873
4547	NC_021081	GGCT	2	8	223656	223663	0 %	25 %	50 %	25 %	482881873
4548	NC_021081	GCC	2	6	223760	223765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881873
4549	NC_021081	ACC	2	6	223802	223807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881873
4550	NC_021081	ATAG	2	8	223829	223836	50 %	25 %	25 %	0 %	482881873
4551	NC_021081	CAA	2	6	223882	223887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881873
4552	NC_021081	CAA	2	6	223927	223932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881873
4553	NC_021081	CGG	3	9	223935	223943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881873
4554	NC_021081	GGC	2	6	223987	223992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881873
4555	NC_021081	TGC	2	6	224085	224090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881873
4556	NC_021081	ACGGC	2	10	224151	224160	20 %	0 %	40 %	40 %	482881873
4557	NC_021081	GGCGG	2	10	224165	224174	0 %	0 %	80 %	20 %	482881873
4558	NC_021081	ACG	2	6	224199	224204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881873
4559	NC_021081	CTG	2	6	224240	224245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881873
4560	NC_021081	GGT	2	6	224293	224298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881873
4561	NC_021081	ACC	2	6	224357	224362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881873
4562	NC_021081	CGG	2	6	224403	224408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881873
4563	NC_021081	GCT	2	6	224409	224414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881873
4564	NC_021081	GGC	2	6	224420	224425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881873
4565	NC_021081	GAG	2	6	224462	224467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881873
4566	NC_021081	CAG	2	6	224489	224494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881873
4567	NC_021081	CGA	2	6	224500	224505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881873
4568	NC_021081	AGC	2	6	224511	224516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881873
4569	NC_021081	CCGGC	2	10	224730	224739	0 %	0 %	40 %	60 %	482881874
4570	NC_021081	GGC	2	6	224745	224750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881874
4571	NC_021081	G	7	7	224820	224826	0 %	0 %	100 %	0 %	482881874
4572	NC_021081	CTT	2	6	224829	224834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881874
4573	NC_021081	GGC	2	6	224910	224915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881874
4574	NC_021081	CGC	2	6	224946	224951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881874
4575	NC_021081	CTG	2	6	224998	225003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881874
4576	NC_021081	GGC	2	6	225014	225019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881874
4577	NC_021081	ACC	2	6	225065	225070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881874
4578	NC_021081	ACC	2	6	225110	225115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881874
4579	NC_021081	AGA	2	6	225141	225146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881874
4580	NC_021081	CTG	2	6	225169	225174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881874
4581	NC_021081	TGG	2	6	225188	225193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881874
4582	NC_021081	CAT	2	6	225252	225257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881874
4583	NC_021081	CCA	2	6	225264	225269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881874
4584	NC_021081	TCCT	2	8	225271	225278	0 %	50 %	0 %	50 %	482881874
4585	NC_021081	ATC	2	6	225334	225339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881874
4586	NC_021081	GAG	2	6	225364	225369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881874
4587	NC_021081	CAT	2	6	225384	225389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881874
4588	NC_021081	ACG	2	6	225422	225427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881874
4589	NC_021081	CAT	2	6	225507	225512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881874
4590	NC_021081	GTG	2	6	225532	225537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881874
4591	NC_021081	TTC	2	6	225619	225624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881875
4592	NC_021081	TGA	2	6	225642	225647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881875
4593	NC_021081	TGG	2	6	225648	225653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881875
4594	NC_021081	G	7	7	225656	225662	0 %	0 %	100 %	0 %	482881875
4595	NC_021081	CACC	2	8	225702	225709	25 %	0 %	0 %	75 %	482881875
4596	NC_021081	CCG	2	6	225710	225715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881875
4597	NC_021081	AACG	2	8	225764	225771	50 %	0 %	25 %	25 %	482881875
4598	NC_021081	TGT	2	6	225784	225789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881875
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4600	NC_021081	AGC	2	6	225845	225850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881875
4601	NC_021081	TTC	2	6	225860	225865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881875
4602	NC_021081	AGG	2	6	225891	225896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881875
4603	NC_021081	GGCCG	2	10	226025	226034	0 %	0 %	60 %	40 %	482881875
4604	NC_021081	CG	3	6	226071	226076	0 %	0 %	50 %	50 %	482881875
4605	NC_021081	ACG	2	6	226212	226217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881875
4606	NC_021081	GCA	2	6	226218	226223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881875
4607	NC_021081	GCG	2	6	226224	226229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881875
4608	NC_021081	CGG	2	6	226353	226358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881875
4609	NC_021081	GCT	2	6	226507	226512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881875
4610	NC_021081	CCG	2	6	226540	226545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881875
4611	NC_021081	TGA	2	6	226572	226577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881875
4612	NC_021081	CAG	2	6	226580	226585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881875
4613	NC_021081	GCC	2	6	226625	226630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881875
4614	NC_021081	CAGCTC	2	12	226643	226654	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	482881875
4615	NC_021081	GC	3	6	226741	226746	0 %	0 %	50 %	50 %	482881875
4616	NC_021081	TGC	2	6	226749	226754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881875
4617	NC_021081	GTG	2	6	226823	226828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881875
4618	NC_021081	TTGCT	2	10	226943	226952	0 %	60 %	20 %	20 %	482881876
4619	NC_021081	CTGGCC	2	12	226963	226974	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	482881876
4620	NC_021081	CCCA	2	8	226984	226991	25 %	0 %	0 %	75 %	482881876
4621	NC_021081	GCC	2	6	227065	227070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881876
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4743	NC_021081	AGC	2	6	232071	232076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881879
4744	NC_021081	GC	3	6	232113	232118	0 %	0 %	50 %	50 %	482881879
4745	NC_021081	AGCACC	2	12	232245	232256	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	482881879
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4752	NC_021081	GCC	2	6	232717	232722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881880
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4857	NC_021081	TGGC	2	8	238597	238604	0 %	25 %	50 %	25 %	482881886
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4862	NC_021081	C	6	6	239003	239008	0 %	0 %	0 %	100 %	482881886
4863	NC_021081	GCA	2	6	239017	239022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881886
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4987	NC_021081	GGT	2	6	245565	245570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881892
4988	NC_021081	TAC	2	6	245662	245667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881892
4989	NC_021081	CTG	2	6	245693	245698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881892
4990	NC_021081	GCA	2	6	245745	245750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881892
4991	NC_021081	GCT	2	6	245826	245831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881892
4992	NC_021081	GGTG	2	8	245832	245839	0 %	25 %	75 %	0 %	482881892
4993	NC_021081	A	6	6	246002	246007	100 %	0 %	0 %	0 %	482881892
4994	NC_021081	AGG	2	6	246067	246072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881893
4995	NC_021081	GGT	2	6	246119	246124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881893
4996	NC_021081	TCC	2	6	246212	246217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881893
4997	NC_021081	C	6	6	246216	246221	0 %	0 %	0 %	100 %	482881893
4998	NC_021081	GTG	3	9	249390	249398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881894
4999	NC_021081	CGC	2	6	249459	249464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881894
5000	NC_021081	CCG	2	6	249478	249483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881894

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